-
ריצוף אילומינה
כל מה שרצית לדעת על ריצוף אילומינה:ריצוף אילומינה (באנגלית: Illumina dye sequencing), 'שיטת ריצוף וצביעה של אילומינה' היא טכניקה המשמשת לקביעת הרצף של זוגות בסיסים ב-DNA, הידועה גם בשם הכללי, ריצוף דנ"א. השיטה פותחה על ידי חוקרים בחברת Manteia Predictive Medicine (אשר נרכשה על ידי חברת סולקסה [Solexa] ב-2004) וסולקסה עצמה, אשר גם היא נרכשה…
-
ריצוף DNA
כל מה שרצית לדעת על ריצוף DNA:ריצוף DNA (בעברית הַרְצָפָה) הוא תהליך של קביעת סדר הנוקלאוטידים בקטע דנ"א או רנ"א. בגלל חשיבותו של תהליך הריצוף, פותחו שיטות לריצוף מהיר של מקטעים ארוכים. עדיין, שיטת הריצוף השכיחה ביותר, ואשר באמצעותה נקבעו מרבית הרצפים הגנטיים הידועים כיום מאפשרת קריאה של מקטעים קצרים יחסית, בדרך כלל פחות מ-1000…
-
ריצוף DNA
כל מה שרצית לדעת על ריצוף DNA:ריצוף DNA (בעברית הַרְצָפָה) הוא תהליך של קביעת סדר הנוקלאוטידים בקטע דנ"א או רנ"א. בגלל חשיבותו של תהליך הריצוף, פותחו שיטות לריצוף מהיר של מקטעים ארוכים. עדיין, שיטת הריצוף השכיחה ביותר, ואשר באמצעותה נקבעו מרבית הרצפים הגנטיים הידועים כיום מאפשרת קריאה של מקטעים קצרים יחסית, בדרך כלל פחות מ-1000…
-
Shotgun sequencing
כל מה שרצית לדעת על Shotgun sequencing:בגנטיקה, shotgun sequencing או shotgun cloning (בתרגום מילולי: ריצוף בשיטת רובה הציד) היא שיטה המשמשת לריצוף גדילי DNA ארוכים. שיטה זו נקראת כך כאנלוגיה לדפוס הירי האקראי למחצה והמתפשט במהירות של רובה הציד.מאחר ששיטת ה-chain termination ("סיום השרשרת", מכונה גם ריצוף בשיטת סנגר) לריצוף DNA יכולה לשמש רק עבור…
-
תעלות מרצפות
כל מה שרצית לדעת על תעלות מרצפות:תעלות מרצפות היא שיטת ריצוף DNA בשלבי פיתוח המבוססת על חדירת הגדילים המרוצפים דרך ממברנה טבעית או מלאכותית בעלת חריר בקוטר של ננומטרים בודדים (תעלה יונית) הנמצאת בתוך תמיסה פיזיולוגית. מדידת שינויים חשמליים בתמיסות בין שני צדדי הממברנה או בחריר עצמו- התלויים בסוג הבסיס החודר, מאפשרת את זיהוי הבסיס…
-
פרויקט הגנום האישי
כל מה שרצית לדעת על פרויקט הגנום האישי:פרויקט הגנום האישי (באנגלית: Personal Genome Project, בראשי תיבות: PGP) הינו מחקר עוקבה ארוך-טווח, אשר שם לו למטרה לרצף ולפרסם את רצף הגנום השלם של 100,000 מתנדבים לצד הרשומה הרפואית המלאה שלהם. חזון הפרויקט, שהחל בשנת 2005, הוא לאפשר התקדמות במחקר הגנומיקה האישית ופיתוח הרפואה המותאמת אישית. הפרויקט…
-
סינטניה
כל מה שרצית לדעת על סינטניה:בגנטיקה קלאסית, המושג סינטֶניה (synteny; מיוונית: "מאותו קטע") מתאר את הימצאותם של גנים על גבי אותו כרומוזום. כיום המושג משמש גם לתיאור לא רק עצם הימצאותם אלא גם לתיאור הרצף הספציפי של הגנים על גבי הכרומוזום, ולשם כך משמש גם המונח "סינטניה משותפת" (shared synteny).המושג הקלאסי התבסס על צימוד גנטי…
-
גנומיקה אישית
כל מה שרצית לדעת על גנומיקה אישית:גנומיקה מותאמת אישית (באנגלית: Personal Genomics), היא ענף בתחום הגנומיקה, העוסק בריצוף, ניתוח ואפיון הגנום של אנשים פרטניים. על מנת לבצע אפיון גנומי זה, הענף משתמש בשיטות שונות, לרבות אפיון של SNP, מערכי DNA לאנליזה, והרצפה מלאה או חלקית של הגנום. לאחר ריצוף הגנום האינדיבידואלי, ניתן להשוות אותו לגנום…
-
ChIP-seq
כל מה שרצית לדעת על ChIP-seq:ChIP-seq או ChIP-sequencing היא שיטה המשלבת מיצוי נוגדני של כרומטין (ChIP) יחד עם ריצוף מסיבי של DNA כדי לחקור אינטרקציות של חלבונים עם DNA. שיטה זו מאפשרת לזהות אתרי קישור ב-DNA המקושרים לחלבונים, ולזהות את כל האתרים האלו בצורה גלובלית (למשל על פני כל הגנום) עבור חלבון מסוים. בעבר הייתה…
-
RNA-seq
כל מה שרצית לדעת על RNA-seq:רנ"א-סק (ריצוף-רנ"א), הקרוי גם "ריצוף טרנסקריפטום שלם בשיטת שוט-גאן", מתייחס לשימוש בטכנולוגיות ריצוף בתפוקה-גבוה (high-throughput sequencing) של רצפי דנ"א קומפלמנטרי (cDNA) על מנת לקבל אינפורמציה לגבי תכולת הרנ"א של דגימה נחקרת. הטכניקה אומצה למחקרי מחלות כגון סרטן. עם כיסוי עמוק ורזולוציה ברמת הבסיס, שיטות ריצוף הדור-הבא (next-generation sequencing) מספקות אינפורמציה…